中铁二院重庆勘察设计研究院有限责任公司成立于1983年7月，在此后的23年时间里，主要从事铁路、公路等的测绘及勘探工作。2007年1月，中铁二院工程集团有限责任公司完成改制后，重庆公司被重新定位，赋予了新的职能，主营业务由勘测转型为设计。2010年6月，根据中铁二院工程集团有限责任公司在勘察设计领域战略布局调整和本土化经营的需要，为更好地适应重庆市经济高速发展和全面参与重庆市建设国家中心城市的各项基础设施建设，重庆公司改制成为中铁二院工程集团有限责任公司的全资子公司。
从2007年至2011年的五年间，重庆公司实现了主营业务转型和公司改制两步重大跨越。技术水平快速提升，设计能力大幅增强，承担了大量铁路、城市轨道交通、公路、市政、地质灾害防治的勘察设计任务。企业经济效益强劲增长，经济指标连续五年创新高，营业收入增长5.6倍、利润总额增长19.5倍、新签自揽合同额增长58.3倍、年人均产值增长2.2倍。入选重庆北部新区2011年度服务业二十强企业.